Ученый совет DSc27.06.2017.Fil.20.01 при Каракалпакском государственном университете утвержден Постановлением ВАК № 86 от 2017 года.
Ученому совету разрешено защищать диссертации по филологическим дисциплинам 10.00.03-Каракалпакский язык и 10.00.12-Каракалпакская литература. Также согласно Постановлению № 180 ВАКа от 28 июня 2018 года было разрешено создать разовый совет и защита по специальности 10.00.05-Языки и литература стран Азии и Африки (казахский язык).Ученый совет состоит из 13 членов: Ш.Абдиназимов – председатель, К.Алламбергенов — заместитель председателя, Т.Керуенов – научный секретарь, члены — М.Айимбетов, К.Жаримбетов, М.Қудайбергенов, Г.Карлибаева, Ю.Ибрагимов, К.Оразимбетов, К.Курамбаев, С.Рузимбоев, З.Дусимов, З.Бекбергенова.В недавно утвержденном научном совете были защищены на докторские диссертации на соискание ученой степени доктора философских наук: 12 января 2018 года соискатель отдела каракалпакской литературы Республики Каракалпакстан Ю.О.Каниязовой на тему «Мастерство создания характера в романах Ш.Сейтова» (на примере романа-тетралогии «Халкабад»), 30 апреля 2018 года, на соискание докторской степени кафедры каракалпакской литературы Нукусского государственного педагогического института им. П.А.Дабыловой на тему «Характеристика лирического героя каракалпакской поэзии». Повесть Матмуратова и К.Рахманова), 14 сентября 2018 года докторант кафедры каракалпакского языка Нукусского государственного педагогического института Г.Я. Мамбетовой на тему «Гидрономические термины северных районов Каракалпакстана». 22 октября 2018 года филологический факультет Каракалпакского государственного университета (казахский язык) на основании Постановления № 180 от 28 июня 2018 года выдал разрешение на создание и защиту научного совета по специальности «Язык и литература народов Азии и Африки» (казахский язык, туркменский язык). Были защищены докторские диссертации на ученом совете с целью получения ученой степени: Г.Адилова, старший преподаватель кафедры «Лингвистический анализ этнографов казахов Каракалпакстана», 22 октября 2018 года соискатель Нукусского государственного педагогического института, старший преподаватель кафедры казахского языка и литературы Ы.Куттымуратова по филологическим наукам на тему «Казахский язык в Кунградском районе Республики Каракалпакстан».В 2018 году были защищены 5 соискателей и 2019 годы 1 докторант защитили диссертации на соискания ученой степени доктора философии (PhD).2018 году Ученом совете диссертации на соискание ученой степени доктора наук (DSc) не были рассмотрены и защищены.В 2019 году на ученых советах планируется защитить в общей сложности 1 доктор наук (DSc) и 7 диссертаций на соискание доктора философии (PhD)

С 28 сентября 2018 года Ученый совет по педагогическим наукам 28.12.2017.Ped.58.01 переведен из Нукусского государственного педагогического института в Каракалпакский государственный университет имени Бердаха.В этом ученом совете 2018 году защищены 7 диссертации соискания звания доктора философии и 1 в 2019 году.